La cartilamina è perfettamente tollerata dalla stragrande maggioranza delle persone. Tuttavia, raramente sono stati segnalati disturbi digestivi, generalmente lievi e transitori, possibilmente attribuibili all'assunzione di cartilamina. L'uso della cartilamina non è raccomandato nelle donne in gravidanza o durante l'allattamento (in assenza di dati) così come (a causa della sua origine).
I prodotti a base di cartilamina non contengono iodio. Tuttavia, se sei allergico allo iodio, non è consigliabile assumere la cartilamina come precauzione perché potresti essere allergico. L'uso di Cartilamina è sconsigliato in caso di allergia nota ad uno dei suoi costituenti, ovvero gli agenti di confezionamento standard per compresse o compresse farmaceutiche (l'elenco completo è riportato sul retro della scatola di ciascun prodotto Cartilamina).